Jeremy Johnson | Prescott College

Jeremy Johnson

Ph.D.
Akademisk erklæring

Jeg blev interesseret i skovøkologi, mens jeg voksede op nær fronten af ​​Rocky Mountains i Colorado. Efter at have afsluttet min kandidatuddannelse i naturressourcer ved Colorado State University brugte jeg flere år i National Park Service og US Forest Service (begge i Arizona), før jeg afsluttede en ph.d. i geografi med fokus på skovlandskabsgenetik ved Texas A&M University. Jeg har haft stillinger som gæsteassistent ved Texas A&M University som underviser i biogeografi, og jeg har haft en fælles postdoktoraftale med Northern Arizona University i School of Forestry og med USDA Forest Service i Dorena Genetic Resource Center i Cottage Grove, Oregon hvor jeg var i stand til at tilbringe min tid omgivet af de høje træer i Pacific Northwest.

Jeg er en skovøkolog og genetiker med brede undervisnings- og forskningsinteresser, der er rettet mod at forstå de rumlige og tidsmæssige mønstre for, hvordan skove reagerer på flere trusler forbundet med global økologisk ændring ved at specialisere mig i brugen af ​​geografiske, landskabsøkologiske og genetiske værktøjer og teori. Specifikt undersøger jeg mønstre for plantebevægelse gennem spredning af frø, mønstre for lokal tilpasning og naturlig genetisk resistens over for invasive skovsygdomme. Mit mål er at sikre langvarig overlevelse af skove med effektive bevaringsindgreb og forvaltning ved at uddanne den næste generation af økologer og naturforskere.

Uddannelse

2016 Ph.D., Texas A&M University

2011 MS, Texas A&M University

2004 BS, Colorado State University

Akademiske aftaler

2017-2019 Joint Postdoc, USDA Forest Service, Dorena Genetic Resouce Center / Northern Arizona University, School of Forestry

2016-2017 Besøgende adjunkt, Texas A&M University, Institut for Geografi

Publikationer

I gennemgang eller revision

Moler EV, Bucholz ER, Heck E, Johnson JS, Side GFM, Sniezko RA, Waring KM, Wehenkel C, Whipple AV. Til gennemsyn. Frøpræsentationsklima og simuleret klimauppvarmning påvirker frøegenskaber af den sydvestlige hvide fyr. Canadian Journal of Forest Research.

Rogers H, Aslan C, Beckman N, Shea K, HilleRisLambers J, Fricke E, Bronstein J, Brodie JF, Bruna E, Bullock JM, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Gurski K, Hastings A, Hartig F, Johnson JS, Kogan O, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J, Zhou J, Zurell D. Til gennemsyn. Frøspredning og frøpredation - under-værdsat, men kritisk vigtige processer. AoB Planter.

LaRue EA, Dodds W, Rohr J, Dahlin K, Thorp JH, Johnson JS, Hardiman BS, Rodriguez-Gonzalez MI, Keller M, Fahey R, Knott J, SanClements M, Atkins JW, Tromboni F, Chandra S, Parker G, Rose K, Liu J, Fei S. Accepteret. Udviklingen af ​​makrosystemets biologi. Grænser inden for økologi og miljø.

Udgivet eller i pressen

2020

Sniezko RA, Johnson JS, Reeser P, Kegley A, Hansen E, Sutton W, Savin DP. 2020. Genetisk modstand mod Phytophthora lateralis i Port-Orford-cedar (ædelcypres) - Grundlæggende byggesten til et modstandsprogram. Planter, mennesker, planet. DOI: 10.1002 / ppp3.10081

Sniezko RA, Johnson JS, Savin DP. 2020. Evaluering af holdbarhed, stabilitet og anvendelighed af genetisk resistens over for en ikke-hjemmehørende svampepatogen hos to fyrretræer. Planter, mennesker, planet. DOI: 10.1002 / ppp3.49

2019

Rogers H, Beckman N, Hartig F, Johnson JS, Pufal G, Shea K, Zurell D, Bullock JM, Cantrell S, Loiselle B, Pejchar L, Razafindratsmia O, Sandor M, Schupp E, Strickland C, Zambrano J. I tryk Den samlede spredningskerne: En gennemgang og fremtidige retninger. AoB Planter.

Beckman NG, Aslan C, Rogers H, Kogan O, Bronstein J, Bullock JM, Hartig F, HilleRisLambers J, Zhou J, Zurell D, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Effiom E, Fricke E, Gurski K , Hastings A, Johnson JS, Loiselle BA, Miriti M, Neubert MG, Pejchar L, Poulsen JR, Powell JA, Pufal G, Razafindratsima OH, Sandor M, Shea K, Schupp EW, Snell RS, Strickland C, Zambrano J. 2019. Fremme af en tværfaglig ramme for at studere spredningsøkologi. AOB Planter.

Johnson JS, Pufal G, Cantrell S, Cosner C, Hartig F, Hastings A, Rogers H, Schupp EW, Shea K, Yu X, Zurell D. 2019. Hurtige ændringer i frøspredningstræk kan ændre planters reaktioner på global ændring. AoB Planter. DOI: 10.1093 / aobpla / plz020 Editor's Choice

Aslan C, Beckman NG, Rogers H, Bronstein J, Zurell D, Hartig F, Shea K, Pejchar L, Neubert MG, HilleRisLambers J, Miriti M, Loiselle BA, Effiom E, Zambrano J, Schupp EW, Pufal G, Johnson JS, Bullock JM, Brodie JF, Bruna E, Cantrell S, Decker R, Fricke E, Gurski K, Hastings A, Kogan O, Powell JA, Razafindratsima OH, Sandor M, Schreiber SJ, Snell RS, Strickland C, Zhou J. 2019. Anvender funktionelle plantegrupper for at fremme frøspredningsøkologi og -bevaring Eventuelt Planter. DOI: 10.1093 / aobpla / plz006 Editor's Choice

2018

Moler EV, Abakir A, Eleftheriou M, Johnson JS, Krutovsky KV, Lewis L, Ruzov A, Whipple AV, Rajora OP. 2018. Befolkningsepigenomik: Fremme forståelse af fænotypisk plasticitet, akklimatisering, tilpasning og sygdomme. I: Rajora OP, red. Befolkningsgenomik: begreber, tilgange og applikationer: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_59

Johnson JS, Krutovsky KV, Rajora OP, Gaddis KD, Cairns DM. 2018. Fremme af biogeografi gennem population af genomik. I: Rajora OP, red. Befolkningsgenomik: begreber, tilgange og applikationer: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2018_39

2017

Johnson JS, Chhetri PK, Krutovsky KV, Cairns DM. 2017. Vækst og dets forhold til individuel genetisk mangfoldighed i bjerghængslet (Tsuga mertensiana) ved alpin treeline i Alaska: Kombination af dendrochronology og genomics. Skove, 8: 418. DOI: 10.3390 / f8110418

Balkenhol N, Dudaniec RY, Krutovsky KV, Johnson JS, Cairns DM, Segelbacher G, Selkoe KA, von der Heyden S, Wang IJ, Selmoni O, Joost S. 2017. Landskabsgenomik: forståelse af sammenhænge mellem miljømæssig heterogenitet og genomiske egenskaber hos populationer. I: Rajora OP, red. Befolkningsgenomik-koncepter, strategier og applikationer: Springer. DOI: 10.1007 / 13836_2017_2

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2017. Landskabsgenomisk indsigt i den historiske migration af bjerghæmning som svar på Holocene klimaændringer. American Journal of Botany, 104: 439-450. DOI 10.3732 / ajb.1600262 Photo Cover

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovsky KV. 2017. Frøspredning ved alpin treeline: En vurdering af frøbevægelse inden i den alpine treeline økoton. økosfæren, 8: e01649. DOI: 10.1002 / ecs2.1649 (Henry Cowles Award fra American Association of Geographers, der hvert år gives til en forsker for at være fremragende i en offentliggjort forskningsartikel i biogeografi)

2016

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Lafon CW, Krutovsky KV. 2016. Plantsvar på global ændring: Næste generations biogeografi. Fysisk geografi, 37: 93-119. DOI: 10.1080 / 02723646.2016.1162597

2013

Johnson JS, Cairns DM, Houser C. 2013. Coastal Marsh Vegetation Assemblages of Galveston Bay: Insights for East Texas Chenier Plain. vådområder, 33: 861-870. DOI: 10.1007/s13157-013-0443-8

Præsentationer

Inviterede samtaler:

Johnson JS. ”Hvad er chancerne? - At afsløre samspillet og påvirkningen af ​​sygdom og klimaændringer på den sydvestlige hvide fyrretræ ”Invited Talk May 1, 2019. Northern Arizona University School of Forestry Seminar Series. Flagstaff, AZ

Johnson JS. ”Skovsundhed og genetik: Forskningsdesignovervejelser” Inviteret marts 20, 2019. California State University, Dominquez Hills, Institut for Geografi, Carson, CA

Johnson JS. ”Nye grænser inden for skovbrug: Kombination af fenomik, fælles haver og landskabsgenomik for at tackle sygdomsresistens og klimaforandringer” Invited Talk August 7, 2018. IUFRO International Workshop: Træbestandighed mod insekter og sygdomme: At sætte løfte i praksis, Mt. Sterling, OH

Johnson JS. “En flerskala-vurdering af spredning af frø ved hjælp af landskabsgenetik” Invited Talk oktober 5, 2017. Oregon State University College of Forestry, Department of Forest Ecosystems and Society, Corvallis, OR

Johnson JS. “Skove på farten: Et landskabsgenetisk perspektiv” Inviteret Talk september 15, 2017. University of North Texas Institut for Geografi og miljø Seminarserie "Crosscurrents", Denton, TX

Johnson JS. “Skove på farten”. Inviteret samtale marts 3, 2017. Texas A&M University Department of Geography Spring Colloquium Series, College Station, TX

Johnson JS. “Skove på farten”. Inviteret samtale februar 6, 2017. California State University, Fullerton, Institut for Geografi Seminar Series, Fullerton, CA

Johnson JS. ”Afvikling af spredningsbegrænsning og genomvariation i tre skovarter ved hjælp af en liggende genomisk tilgang ”Invited Talk juli 24, 2015. Landcare Research - Seminar Series, Landcare Research, Lincoln, New Zealand

Johnson JS. "Geografi om periferien: Et tilfælde af tværfaglig forskning i genomikens tidsalder." Foredrag præsenteret på Texas A&M University Geography Society-mødet, april 8, 2014, College Station, TX.

Valgte konferencepræsentationer:

Johnson JS, Sniezko RA, Waring KM. 2019. Evaluering af holdbarhed, stabilitet og anvendelighed af genetisk resistens over for et ikke-nativt svampepatogen i femnål Pines. Papir præsenteret på 15. Biennale Konference for Videnskab og Ledelse på Colorado Plateau og Southwest Region 9 - 12. september, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Sniezko RA, Mackin H, Heck E, Lewine M, Brons D, Mccoy S, Kegley A, Page GFM, Haagsma M, Still C, Waring KM. 2019. Karakteriserende genetisk modstand mod hvid fyrblisterrost i den sydvestlige hvide fyr. Papir, der skal præsenteres på 2019 IUFRO Genetik af fem nåle Pines 22-26 Juli Invermere, British Columbia, Canada

Johnson JS Omfang brede rumlige mønstre med større genresistens i sydvestlig hvid fyr til hvid fyrblisterrost. Papir præsenteret på 2019 North American Forest Ecology Workshop 23-27 Juni, Flagstaff, AZ

Johnson JS, Waring KM, Wehenkel C, Leal Saenz A, Jacobs JJ, Sniezko RA. 2018. Det ligger i deres gener - Identificering af mønstre for genetisk modstand mod blisterrust i den sydvestlige hvide fyr. Papir præsenteret på Society of American Foresters National Convention 3-7 oktober, Portland, OR

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM og Krutovsky KV. 2017. Opretholder spredning på lang afstand alpin treeline? Papir præsenteret kl Årlige konference for American Association of Geographers, 5-9 April, Boston, MA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM og Krutovsky KV. 2016. Frøspredning ved alpin treeline: Spredning i lang afstand opretholder alpine treelines. Papir præsenteret kl Årskonference for American Geophysical Union, 12-16 december, San Francisco, CA.

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Krutovsky KV. 2016. Historisk respons fra bjerghæmning på Pleistocene glaciations ved dens rækkevidde i Alaska, USA. Papir præsenteret kl IUFRO Konference om genetik og skovtrægenetik, 30 Maj -4 juni., Arcachon, Frankrig

Johnson JS, Gaddis KD, Cairns DM, Konganti K, Krutovsky KV. 2016. Untangling Holocene migrationsprocesser af bjerghæmlock på Alaskan Kenai Peninsula. 1st Sted: Biogeography Speciality Paper Paper Competition. Papir præsenteret på Årlige konference for American Association of Geographers, 29 marts -2 april., San Francisco, CA

Johnson JS, Gaddis, KD og Cairns DM. 2015. Landskabsbestandighed eller isolering ved afstand: Skovrespons på Pleistocene-isdannelser i Alaska. 2nd Sted: Papirkonkurrence. Papir præsenteret kl TAMU GIS-dag, 17 November., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM og Gaddis, KD. 2015. Kast din skæbne mod vinden: Langdistanse-spredning i Mountain Hemlock. Papir præsenteret på South West Association of American Geographers Årskonference, 4-7 november., San Antonio, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovsky KV. 2015. Hvem er din far? Genomics afmystificerer spredning ved en Alaskan-treeline. Papir præsenteret kl Peth III: Mountains of Our Future, 4-8 oktober., Perth Skotland

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis KD, Krutovsky KV, Konganti K. 2015. Genomik for langdistansespredning i bjerghæmlock. Papir præsenteret på Association of American Geographers Årskonference, 21-25 April., Chicago, IL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV og Goldberg DW. 2014. Landskabsgenetik tilgange i økologisk biogeografi: En casestudie, der anvender Douglas Fir (Pseudotsuga menziesii) i det nordvestlige Stillehav. Papir præsenteret på Association of American Geographers Årskonference, 8-12 April., Tampa, FL

Johnson JS, Cairns DM, Krutovsky KV og Goldberg, DW. 2013. Integration af genetik og genomik i økologisk biogeografi: En casestudie, der anvender Douglas Fir (Pseudotsuga menziesii) i det nordvestlige stillehav. Paper fremlagt på South West Association of Årlige konference for American Geographers, 24-26 oktober., Nacogdoches, TX

Washington-Allen RA, Thompson SM, Hays DB, Delgado A, Li J, Brademan WT, Popescu S, Martínez Peña RM, Huber-Sannwald E, Brademan C, March RG, Johnson JS, Modala NR, Reeves MC, Mitchell JE og Kulawardhana RW. 2013. En oversigt over brugen af ​​fjern sensingsteknologier til vurdering af tørlandsproduktion og nedbrydning på lokalt til globalt plan. Papir præsenteret på Mexicansk Society of Ecology Conference, 18-22 marts., Villahermosa, Tobasco Mexico

Washington-Allen RA, Johnson JS, van Riper C, Modala N, Barnes M, Brademan C, Bruton R, Delgado A, Kim J, March R, Saenz N, Srinivasan S, Reeves MC. 2012. Overvågning og vurdering af amerikanske tørlande. Papir præsenteret på Årskonference for American Geophysical Union, 3-7 December., San Francisco, CA

Johnson JS, Cairns DM og Houser C. 2012. Marsh-vegetationssamlinger i East Bay of Galveston Bay: en hierarkisk klassificering. Papir præsenteret på Association of American Geographers Årskonference, 24-28 februar., New York, NY

Johnson JSog Cairns DM. 2011. Ændring af vegetationsdynamik for en kystmyr: Galveston Bay, Texas. Papir præsenteret på Association of American Geographers Årskonference, 12-16 April., Seattle, WA

Valgte plakatpræsentationer (*betegner forfatter til studerende):

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Still C, Waring KM, Sniezko RA, Selkor J. 2019 Objektiv identifikation af syge planter fra hyperspektrale billeder ved hjælp af maskinlæring. Plakat præsenteret kl American Geophysical Union, 9.-13. December, San Francisco, Californien

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Haagsma M, Johnson JS, Page, G, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M, og Moler E. 2019. Tilpasning og tilpasning af et træ til sygdom og ariditet. Plakat præsenteret kl NSF Macrosystems Biology PI-Meeting , 15-17 maj, Boulder, CO

Haagsma M, Page, GFM, Johnson JS, Still C, Selkor J. 2018. Brug af hyperspektrale billeder til at påvise en invasion af svampepatogen og bestemme symptomens sværhedsgrad i Pinus strobiformis kimplanter. Plakat præsenteret kl American Geophysical Union, 10-14 december, Washington, DC

Johnson JS, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Haagsma M, Heck E, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M, Moler E, Page G, og Waring K. 2018. Tilpasning og akklimatisering af et træ til sygdom og ariditet. Plakat præsenteret på IUFRO 6th Internationalt værksted om genetik for interparationer mellem træ-parasitter: træresistens mod insekter og sygdomme: sætte løfte ud i livet, 05-10 August, Mt. Sterling, OH

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M, Justin Bagley, Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E, Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M og Moler E. 2018. Tilpasning og akklimatisering af et træ til sygdom og ariditet. Plakat præsenteret kl NSF Macrosystems Biology PI-Meeting , 08-10 januar, Alexandria, VA

Waring K, Cushman S, Eckert A, Flores Renteria L, Sniezko R, Still C, Wehenkel C, Whipple A, Wing M Boes E, Bucholz E, Burnett J, Castilla A, DaBell J, Friedline C, Garms C, Heck E , Johnson JS, Leal Saenz A, McTeague B, Menon M og Moler E. 2017. Blanding af økologi og evolution ved hjælp af nye teknologier til at bestemme artsfordelinger med et ikke-nativt patogen i et skiftende klima. Plakat præsenteret kl IUFRO: Skovregenerering i skiftende miljøer, 11-13 juli, Corvallis, OR

Gaur K*, Brandon Mann W*, Hou D*, Nolasco C*, McAfee L*, Hingrajiya K*, Johnson JS, og Chhetri PK. 2016. Træring vækst mønster af Abies spectabilis fra sub-alpin skov i Dhorpatan Hunting Reserve, vestlige Nepal. Plakat præsenteret kl South West Division i American Association of Geography årlig konference, 20-22 oktober, Denton, TX

Johnson JS, Cairns DM, Gaddis og Konganti K. 2015. Genstrømning ved alpin treeline: Hvor kommer disse frø fra? Vinder: 1st sted (kategori: Genetik og genomik). Plakat præsenteret kl Texas A&M Institute for Genome Sciences and Society Symposium, 8-9 oktober., College Station, TX

Johnson JS, Cairns DM †, og Krutovsky KV. 2014. Landskabsgenetik og genstrøm i Douglas-Fir kyst (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii. Plakat præsenteret kl MtnClim, 15-18 september., Midway, UT

Johnson JS, Krutovsky KV, Cairns DM og Goldberg, DW. 2014. Karakterisering og visualisering af genstrømning i Coastal Douglas-Fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco var. menziesii): En landskabsgenetisk tilgang Poster præsenteret kl Ecological Society of America National Conference, 10-15 August., Sacramento, CA

Johnson JSog Cairns DM. 2010 Vegetationsklassificering af en kystsaltmyr: Galveston Bay, Texas. Plakat præsenteret på South West Division of the Association of American Geographers Conference, 14-16 oktober., Tahlequah, OK

Priser, tilskud og hædersbevisninger

Tilskud

2020-2021 USDA Forest Service - Effektiviteten af ​​major genresistens i et opvarmende klima for fem nåle fyrretræer. (Co-Pi med RA Sniezko) ($ 75,000)

2019-2021 USDA Forest Health Protection: Special Technology Development Project - Tidlig identifikation af symptomer på hvid fyrblisterrostsygdom gennem udviklingen af ​​en fænotypeplatform til høj omkostning (PI, med Co-PI'er K Waring, G Page, C Still, M Haagsma, J Selkor, R Sniezko) ($ 349,077)

2018 National Science Foundation - Forskningserfaring til supplerende studerende - Macrosystems Biology: Blanding af økologi og evolution ved hjælp af nye teknologier til at bestemme artsfordelinger med et ikke-nativt patogen i et skiftende klima: sydvestlig hvid fyr (Pinus strobiformis) (Co-PI med PI C Still) ($ 6,750)

2015 National Science Foundation - East Asia and Pacific Summer Institute Fellowship, New Zealand EAPSI: Vurdering af spredningsbegrænsning af frø som en årsag til pludselige trelinjer i New Zealand ($ 9000)

2013-2015 National Science Foundation Doktorafhandling Dokumentation for forbedring af forskning - Geografi og geografisk videnskab DDRI: En genetisk tilgang til spredning ved den alpine treeline-økoton (Co-PI, med DM Cairns) ($ 15,987)

2013-2014 Texas A&M Institute of Genome Sciences and Society Fellowship. Texas A&M University En genomisk tilgang til spredning af frø ved den alpine treeline-økoton og dens konsekvenser for et skiftende klima ($ 22,000)

Priser

2018 Henry Cowles Award fra American Association of Geographers, der hvert år gives til en forsker for at være fremragende i en for nylig offentliggjort forskningsartikel i biogeografi: forum Frøspredning ved alpin treeline: en vurdering af frøbevægelse inden for den alpine treeline økoton. økosfæren

2016 Bedste ph.d.-præsentation: American Association of Geographers Biogeography Speciality Group

2015 Chimborazo PhD Student Research Award: American Association of Geographers Mountain Geography Speciality Group:

2015 Texas A&M Institute for Genome Sciences and Society bedste præsentation i kategorien genetik og genomik

2014 klimaændringsvidenskabsinstitut ved Oak Ridge National Laboratory: Early Career Award

2014 Ecological Society of America, Award Population Ecology Travel Award